HPV病毒預防性疫苗作用機制的前提是，人體還未被HPV病毒感染。高危型HPV病毒，只有形成蛋白外殼的病毒粒子，才對宿主細胞具有侵襲力。換句話說，入侵人體宿主細胞的高危型HPV病毒，雖然目前仍不清楚是由游離的還是封閉在脫落的鱗狀上皮細胞內(nèi)的病毒，但是該病毒為完整的病毒顆粒，是“活動性感染”（Active Infection）模式。人體注射HPV病毒疫苗后，如HPV病毒粒子感染細胞，中和抗體必須在自然的感染部位-粘膜起作用，此時入侵的高危型HPV病毒還沒有機會形成“潛伏性感染”，病毒DNA也就沒有機會與宿主細胞核DNA（基因組）整合，不會產(chǎn)生“免疫逃逸”，因此來犯病毒即被抗體介導的“中和反應”所全部清除，形成保護。